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揭開(kāi)未知菌種的神秘面紗

發(fā)布時(shí)間:2023-01-09 15:55:00來(lái)源: 中國(guó)青年報(bào)

  這是一個(gè)色香俱全的實(shí)驗(yàn)室。

  在一個(gè)個(gè)燕麥培養(yǎng)基中加入金屬離子,燕麥味道一會(huì)兒便飄香了半間屋子,這是“北工商”鏈霉菌最喜歡的生存環(huán)境;在另一個(gè)培養(yǎng)皿里,被分離出來(lái)的單孢哈薩克斯坦酵母菌會(huì)散發(fā)出清香的氣味,呈現(xiàn)出圓形小顆粒形狀;而被加入了“北工商”海洋桿菌的培養(yǎng)液中,液體顏色則逐漸變?yōu)辄S酒的焦糖色。

  “各種白酒的酒曲、窖池和釀造環(huán)境,形成了一個(gè)個(gè)獨(dú)特的微生物資源庫(kù),含有大量的未知菌種,這些菌種是我國(guó)特有的、寶貴的微生物資源。它們有哪些生物學(xué)功能?是如何釀造出美酒的?這些亟待我們展開(kāi)研究和開(kāi)發(fā)利用。”

  在長(zhǎng)達(dá)10年的時(shí)間里,北京工商大學(xué)輕工科學(xué)技術(shù)學(xué)院副教授任清帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì),從我國(guó)傳統(tǒng)白酒酒曲、酒醅和窖泥中分離篩選釀酒微生物86個(gè)屬,3000余株細(xì)菌,其中,已經(jīng)鑒定確認(rèn)細(xì)菌新種24種,大部分用“北工商”和“北京”命名,他們正一步步走近藏在酒香里的神秘“群落”。

  走近微生物世界的神秘群落

  對(duì)1996年出生的姑娘劉波來(lái)說(shuō),白酒、黃酒等名詞原本跟她的生活并不相關(guān)。但跟著課題組展開(kāi)兩年多的研究后,每逢過(guò)年,這位研三的學(xué)生就會(huì)在飯桌上跟父親一一科普,指著其中一瓶分辨是濃香型白酒還是清香型白酒,這背后到底是什么微生物在起作用。

  在微觀的世界里,中國(guó)傳統(tǒng)釀酒是依靠微生物發(fā)酵而生產(chǎn)。而在這條肉眼不可見(jiàn)的“生產(chǎn)鏈”上,多個(gè)微生物菌種正有條不紊地分工合作著:當(dāng)人們把釀酒原料和酒曲倒入窖池,根霉和曲霉等霉菌會(huì)加速淀粉變成葡萄糖,酵母菌又將葡萄糖轉(zhuǎn)化為乙醇。醋酸桿菌接過(guò)下一個(gè)生產(chǎn)線,促進(jìn)葡萄糖變成乙酸,乙酸再經(jīng)過(guò)多種微生物的酯化作用生成乙酸乙酯,多種微生物協(xié)力合作,也就初步完成了清香型白酒的釀造。

  “國(guó)外酒風(fēng)味單一,其釀酒主要是單菌種或少數(shù)菌種的液態(tài)發(fā)酵技術(shù),微生物種類(lèi)少,所以,發(fā)酵形成的風(fēng)味物質(zhì)少。而我國(guó)白酒釀造是自然多菌種固態(tài)發(fā)酵,有著獨(dú)特的釀造工藝,靠著幾百年傳承下來(lái)的制曲技術(shù)和老窖池,形成了一個(gè)獨(dú)特的微生物資源庫(kù)。”任清說(shuō)。

  一些名酒之所以風(fēng)味不同,主要是因?yàn)槠溽劸葡到y(tǒng)中微生物群體的差異化造成的。任清解釋?zhuān)绻谄渌胤结劤瞿趁频娘L(fēng)味,就要破解其釀造系統(tǒng)中的微生物群落結(jié)構(gòu)和多個(gè)微生物如何相互作用的難題。而當(dāng)下傳統(tǒng)釀酒行業(yè)過(guò)分依賴(lài)釀酒師和當(dāng)?shù)亟殉兀瑯?biāo)準(zhǔn)化程度低,受到地理氣候和生態(tài)環(huán)境的影響,每一個(gè)窖池、每一批次釀造出來(lái)酒的品質(zhì)也各不相同。

  “如果能用科學(xué)的手段,找到傳統(tǒng)釀酒過(guò)程中是哪些功能微生物起主要作用,并分離這些主要的功能微生物,利用功能微生物就可以實(shí)現(xiàn)‘基于風(fēng)味感知的白酒品質(zhì)定向設(shè)計(jì)’。那么即便在北京也有可能生產(chǎn)出其他名酒,實(shí)現(xiàn)傳統(tǒng)釀造向現(xiàn)代發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)的轉(zhuǎn)變。”任清做了一個(gè)比喻,如果把傳統(tǒng)釀酒工藝看作是一個(gè)系統(tǒng),那么“芯片”就是微生物。

  為了破解“芯片”的密碼,從2013年開(kāi)始,任清帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)利用培養(yǎng)組學(xué)和高通量測(cè)序技術(shù),從龐大的微生物生態(tài)系統(tǒng)中分離菌種,揭秘這一群藏在酒窖里的“群落”如何精密地運(yùn)轉(zhuǎn)。

  像考古探險(xiǎn)一樣摸著黑往前走

  在課題組里,劉波的工作是從龐大微生物生態(tài)系統(tǒng)里篩選菌種。她要從大量的樣本里找到還沒(méi)有被前人發(fā)現(xiàn)的微生物,像考古探險(xiǎn)一樣摸著黑往前走。

  微生物的生存環(huán)境各不相同。在篩選菌種的過(guò)程中需要設(shè)置不同溫度和pH值的培養(yǎng)基,待菌種生成后,純化分離出來(lái),展開(kāi)篩選工作。對(duì)這個(gè)95后姑娘來(lái)說(shuō),篩選菌種是一個(gè)“極其枯燥的過(guò)程”。

  2020年5月,在一次菌種篩選工作中,她為每一個(gè)實(shí)驗(yàn)周期設(shè)計(jì)了360個(gè)培養(yǎng)皿,但養(yǎng)出來(lái)的微生物里都沒(méi)有發(fā)現(xiàn)新的菌種。兩個(gè)月的時(shí)間過(guò)去了,她的生活每天都在做實(shí)驗(yàn)和看數(shù)據(jù)之間重復(fù)著。實(shí)驗(yàn)里使用的培養(yǎng)皿超過(guò)2000多個(gè),堆積起來(lái)比這個(gè)身高175厘米左右的姑娘還要高。

  一天早上,劉波偶然發(fā)現(xiàn)之前的培養(yǎng)皿里長(zhǎng)出了一個(gè)個(gè)形態(tài)幼小的微生物,不易被人察覺(jué)。把它們純化分離出來(lái),在顯微鏡下觀察,經(jīng)過(guò)鑒定發(fā)現(xiàn)是一株新菌,此后該株確定為擬桿菌屬的一個(gè)新種。

  發(fā)現(xiàn)新菌種的驚喜,王鎵璇也曾見(jiàn)證過(guò)。那時(shí)她剛來(lái)課題組不久,正在埋頭做實(shí)驗(yàn),師姐突然從隔壁實(shí)驗(yàn)室跑進(jìn)來(lái),高興地叫起來(lái),“我篩選出突變株了”。

  當(dāng)時(shí),實(shí)驗(yàn)室里所有的人都不約而同地停下來(lái),為她鼓掌。后來(lái)王鎵璇才知道,這位臨近畢業(yè)的師姐已經(jīng)為突變株篩選的問(wèn)題死磕了兩個(gè)月。

  “做科研并非每一天都有意思,有時(shí)候需要多一點(diǎn)堅(jiān)持和耐性。”王鎵璇說(shuō)。

  為何窖池里的微生物群落如此難以發(fā)現(xiàn)?任清解釋?zhuān)煌木N需要的培養(yǎng)基不同,生長(zhǎng)速度不一致,有的三五天才會(huì)長(zhǎng)出形狀,而有的則在第二天早上便已經(jīng)養(yǎng)成。

  但微生物菌種之間的相互作用關(guān)系非常復(fù)雜,有時(shí)單一菌種無(wú)法產(chǎn)生風(fēng)味,需要跟另一個(gè)菌種相互作用才能呈現(xiàn)出特定的性狀。這時(shí),就需要在實(shí)驗(yàn)之中用生物信息學(xué)等知識(shí)展開(kāi)關(guān)聯(lián)性分析,摸索不同微生物之間潛在的“社交關(guān)系”。

  王鎵璇曾遇到過(guò)一個(gè)頑固的微生物。她在分離奇枝菌屬的培養(yǎng)基時(shí),發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)基的表面意外地多出了裂痕。原本以為是因培養(yǎng)基的環(huán)境干燥出現(xiàn)了裂縫,可完成了多項(xiàng)對(duì)照試驗(yàn)后發(fā)現(xiàn),每一組培養(yǎng)基里都有類(lèi)似的裂痕。

  這會(huì)不會(huì)是一種新的微生物?她把培養(yǎng)基的環(huán)境改成了液體,再提取基因組展開(kāi)鑒定,驚奇地發(fā)現(xiàn)新的微生物菌種。在固體培養(yǎng)基的環(huán)境里,這一類(lèi)菌種不會(huì)長(zhǎng)在表面,而會(huì)嵌入到培養(yǎng)基之中,生長(zhǎng)速度長(zhǎng)達(dá)一周左右。

  “做科研就是在枯燥和無(wú)趣之中堅(jiān)持,要大膽地設(shè)想,不斷地給出新的培養(yǎng)環(huán)境,總有一天會(huì)有收獲的。”跟著課題組完成了兩年的研究,1998年出生的姑娘王鎵璇慢慢學(xué)會(huì)了耐著性子做事。

  私下里,任清常帶著課題組的孩子們出去打牙祭。但只要回到實(shí)驗(yàn)室,這位老師對(duì)同學(xué)們的要求極為嚴(yán)格,他常說(shuō),“科研來(lái)不得半點(diǎn)虛假,工作一定要實(shí)打?qū)嵉刈觯绻Y選出來(lái)好的微生物菌種,成果自然就出來(lái)了,但要是篩選不出來(lái),不僅功夫白費(fèi)了,甚至連畢業(yè)都?jí)騿堋!?/p>

  化腐朽為神奇的“微”力量

  近10年的時(shí)間,任清課題組揭開(kāi)了100余種微生物新菌種的神秘面紗。

  “北工商”海洋桿菌是我國(guó)黃酒曲中發(fā)現(xiàn)的唯一新菌種。任清介紹,這個(gè)菌種可以合成番茄紅素和類(lèi)胡蘿卜素等紅色素,不僅可以作為黃酒重要的著色劑,代替焦糖色,還具備良好的抗氧化功能,可廣泛應(yīng)用在保健養(yǎng)生的產(chǎn)品中。

  “‘北工商’食烷菌可以分解石油,生物分解無(wú)法降解的物質(zhì),對(duì)生態(tài)環(huán)境保護(hù)起到了一定的作用。‘北工商’節(jié)桿菌可以合成護(hù)膚成分,用于化妝品行業(yè)。”任清說(shuō),微生物的作用不僅僅在釀酒行業(yè),通過(guò)一系列研究,未來(lái)在食品、護(hù)膚品等行業(yè)都將有廣闊的應(yīng)用前景。

  除了單個(gè)微生物的作用,在微觀世界里,微生物的“社交功能”還可以產(chǎn)生化腐朽為神奇的力量。

  任清曾帶著學(xué)生做過(guò)一組實(shí)驗(yàn)。在進(jìn)行降解人參皂苷的新菌種篩選中,他們用特殊培養(yǎng)基培育,過(guò)了幾天,培養(yǎng)基會(huì)變成黑色。研究后才發(fā)現(xiàn),“北工商”鏈霉菌在培養(yǎng)基之中會(huì)產(chǎn)生一種β-葡萄糖苷酶,使得葡萄糖苷鍵斷裂,讓人參和三七中的普通皂苷轉(zhuǎn)化成藥理活性更高的稀有皂苷,可以顯著提高人參和三七的藥用價(jià)值。

  在研究中,團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)部分微生物還承擔(dān)著“喚醒”其他休眠狀態(tài)菌種的工作,比如“北京”棒桿菌,其基因編碼一個(gè)特殊蛋白質(zhì),可以復(fù)蘇休眠狀態(tài)的細(xì)菌。他們克隆了該基因,正在研究該基因編碼蛋白質(zhì)的復(fù)蘇功能。一旦應(yīng)用到微生物培養(yǎng)中,可以促進(jìn)微生物的“蘇醒”,加速培育過(guò)程。如果應(yīng)用到食品安全檢測(cè)中,可以發(fā)現(xiàn)食品中潛伏的有害微生物。

  10年間,圍繞新菌種資源,團(tuán)隊(duì)開(kāi)展了多項(xiàng)研究應(yīng)用開(kāi)發(fā)工作,獲得授權(quán)國(guó)際發(fā)明專(zhuān)利2項(xiàng),國(guó)家發(fā)明專(zhuān)利10項(xiàng),獲2021年中國(guó)輕工業(yè)聯(lián)合會(huì)科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)1項(xiàng),其中,5項(xiàng)專(zhuān)利已經(jīng)實(shí)現(xiàn)成果轉(zhuǎn)化。

  “酒香里藏著的微生物菌種,是我國(guó)特有的微生物資源。”在任清看來(lái),這個(gè)未知的“群落”還待進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),“未來(lái)的工作是要建立我國(guó)釀酒微生物資源庫(kù),保護(hù)特有的菌種,讓這一群在窖池里流傳百年的‘群落’可以真正服務(wù)社會(huì)的發(fā)展。”

  中青報(bào)·中青網(wǎng)見(jiàn)習(xí)記者 楊潔 來(lái)源:中國(guó)青年報(bào)

(責(zé)編:陳濛濛)

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