麗水境內90%以上的面積是山地，森林覆蓋率81.7%；保存了中國東部地區典型完整的中亞熱帶森林生態系統，垂直帶譜完整，分布著我國東部地區罕見的、大面積的常綠闊葉林地帶性植被。當地珍稀瀕危物種豐富，物種數量居浙江全省之冠，是名副其實的華東重要生態屏障和華東生物王國。

　　從2020年開始，麗水市生態環境局組織了中國科學院動物研究所、南京大學等50余家高校、科研院所，在國內率先開展了生物多樣性本底調查，調查范圍覆蓋麗水全域。歷時近3年的調查中，先后發現了16個新物種：分別為兩棲動物新物種百山祖角蟾，魚類新物種甌江小鰾鮈，昆蟲新物種麗水鉤瓣葉蜂、麗水刺背三節葉蜂、麗水吉松葉蜂、黑翅腮扁蜂、鳳陽巨基葉蜂、百山祖多足搖蚊、百山祖狹搖蚊、斑環狹搖蚊，大型真菌新物種皺蓋油囊蘑、麗水麗絲蓋傘、百山祖老傘、小老傘、近藍紫絲膜菌，植物新物種浙江蕘花。

　　摸清生物“家底”不只著眼新物種，更需要普查?！尔愃纳锒鄻有员Ｗo》白皮書顯示，當地已發現維管植物3687種、陸生脊椎動物635種、大型真菌2040種。轄區內共有國家重點保護野生動植物216種，包括百山祖冷杉、東方水韭、中華秋沙鴨、黿等。