錯那宗的兩名宗本對五世達(dá)賴非常忠誠，也不知道五世達(dá)賴已圓寂，更不知布達(dá)拉宮的用意，認(rèn)為倉央嘉措口出狂言就是妖孽。錯那宗兩宗本當(dāng)時接受倉央嘉措舅父那宗的賄賂，不僅對倉央嘉措給予以應(yīng)有的接待，反而嚴(yán)加拘禁，使其家人陷入極度的恐懼與困境中。

　　錯那宗兩宗本將倉央嘉措及家人關(guān)在一個屋里，整個屋就八柱面積。拉薩要求保證他們的安全，防止有人陷害，便派獄卒守起來。平時將窗戶堵起來，連飯都是從房屋跑煙的煙囪里吊下去。獄卒晚上在門口拴條狗，防止有人挖地道偷襲。若遇上廁所，就將他及家人放出來。當(dāng)時正是冬天，滴水成冰，不給熱的茶飯，僅給點青稞、糌粑面，過著非人的囚徒生活。倉央嘉措在房間里，依舊弄些泥土做宗教用品。

　　尋訪轉(zhuǎn)世靈童的兩位活佛回到拉薩后，已是1686年藏歷2月。他們找到了上百個兒童，奇異兒童達(dá)20多個，認(rèn)為錯那最有可能找到五世達(dá)賴轉(zhuǎn)世靈童，最大可能是一個叫第巴o熱巴的兒子，很多人都認(rèn)為他是轉(zhuǎn)世靈童。

　　1686 年藏歷4 月10 日，第巴o桑杰嘉措再次派曲杰卡熱巴o斯南多吉、多巴o索朗堅贊等人帶上供辨認(rèn)的真假物品、充足的衣物用具、若干加持物、凈水、茯茶以及“吉祥日哈達(dá)”作為布達(dá)拉宮的公文標(biāo)志，再次前去錯那認(rèn)定轉(zhuǎn)世靈童。他們從拉薩出發(fā)，5月5日到達(dá)錯那宗城，倉央嘉措及家人被關(guān)在一間黑屋里，過著非人一般的生活長達(dá)半年之久。宗本前來向兩位活佛獻禮，當(dāng)即被訓(xùn)斥：“你們獻個屁禮，從明天開始，將他們從房屋搬出來，消消毒，掃晦氣?！?/p>

　　曲杰卡熱巴o斯南多吉、多巴o索朗堅贊兩人到達(dá)錯那宗后，在居室內(nèi)進行了一系列佛事活動上供下施，對護法神唐堅嘉措舉行恕衍請百度愿儀式。然后讓靈童就座，進行潔身，把加持物放入口中。靈童坐姿端莊凝重，并露出興奮的情態(tài)。曲杰和多巴二人說:“我倆是你的仆人，你想著誰，就坐到誰的懷抱里去吧!”靈童毫不遲疑地坐到了曲杰卡熱巴o斯南多吉的懷中。宗本甲亞巴拿出兩幅畫有宗喀巴大師和殊勝尊者五世達(dá)賴肖像的唐卡，問道:“你認(rèn)識這個嗎?”靈童看著五世達(dá)賴的唐卡，指著自己的鼻子說：“我!”他還辨認(rèn)出五世達(dá)賴用過的鎮(zhèn)邪橛，拿到手上說:“這是我的!”倉央嘉措尋思了一會兒又說:“我的鎮(zhèn)邪橛比這小，這個卻大?！?/p>

　　翌日，潔身完畢，拿出蓮花生大師三人雕像(蓮花生作為密教祖師，其雕像一般是三人，中為蓮花生，左右各有一女人，據(jù)說一是他的印度女人，一是他的吐蕃女人) 和精制的嘎瑪巴銀制雕像后，靈童立即將前者置于頭頂，而將后者放在胸下。當(dāng)拿出乃瓊大神賜給甲亞巴的一把彎刀和一條哈達(dá)，問這是誰的，他指向了唐卡上的乃瓊畫像。

　　第三天，將一本《檔阿皮朋》和一本漂亮的木刻經(jīng)書交給靈童，他看著前者說:“這是我的本子，這在布達(dá)拉有的是”。并模仿著封面上的圖紋用手隨意地畫了起來，然后打開，從頭到尾看了一遍。第四天，拿出崇威高德王的冠冕(可能是五世達(dá)賴在顧始汗幫助他用武力統(tǒng)一西藏時所戴的象征武功的冠冕) 和班智達(dá)的通人冠給他看。他對曲杰說:“通人冠是你的”。之后，他把崇威高德王冠戴到自己的頭上。

　　第五天，出示了一把精巧的小刀和另一把五世達(dá)賴用過的舊刀，他拿著舊刀說，“這是我的”。接著高興地取下掛在小刀上面的牙簽、剜耳等用了起來。這時曲杰說:“你把新刀子拿去，舊刀子我用”。他說:“新舊刀子的福力是無法比擬的?！钡谖逄?，出示了一把精巧的小刀和另一把五世達(dá)賴用過的舊刀，他拿著舊刀說，“這是我的”。第六天，當(dāng)他人拿出兩個裝有真言芥子的牛角時，他略一尋思，揀起其中前世用過的一個說:“這是我的?！?/p>

　　第七天，人們拿出兩個茶碗，讓他辨認(rèn)，他指著其中的一個說:“我的茶碗是這個”。倉央嘉措每次辨認(rèn)遺物時，他都能準(zhǔn)確無誤的辨認(rèn)出來，而且進餐時，總要先敬神靈，然后才用餐，連同抓糌粑的姿勢也同五世達(dá)賴一模一樣，這使得前去辨認(rèn)的曲杰和多巴等人十分感動。兩位活佛和在場人員當(dāng)場跪下來，雙肘雙膝著地，百感交集。當(dāng)即換衣服，在飲食上盡其所能。兩位法王回拉薩向桑杰嘉措稟報，倉央嘉措當(dāng)時還是一個病人，便對兩個宗本說：“要細(xì)心照料靈童，若出什么差錯，我拿你們試問?！?/p>

　　從此，倉央嘉措開始與父母分居生活，在錯那縣城外的亞瑪絨村，專門為倉央嘉措建造了宮殿式的樓房，由從拉薩派來的近侍僧等六名專人照管、服侍和陪讀，他人不得接近，就連倉央嘉措的父母也不例外。但是，他們對外稱系是五世達(dá)賴?yán)飵煾?、夏魯寺堪布﹒索南喬珠的轉(zhuǎn)世靈童。